
Dans l'environnement, les micro-organismes sont présents partout :
| L'eau |
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| L'alimentation |
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| Notre peau |
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| Le sol |
 |
Le plus souvent, lorsqu'on invoque le terme de "microbe" ou "micro-organisme", on provoque une réaction de
méfiance qui peut s'expliquer par plusieurs raisons. D'une part, ce sont des organismes si petits que l'on ne peut les
voir à l'œil nu, ils sont donc mystérieux et incontrôlables. D'autre part, peu après leur identification (les premiers
grands travaux datant d'une centaine d'années), ils sont reconnus comme responsables de maladie, d'épidémie et
de mort. La microbiologie s'oriente d'abord sur le développement des vaccins et des antibiotiques. Ensuite, les progrès
réalisés en hygiène et en propreté sont associés à une meilleure élimination des micro-organismes.
De tout ceci résulte une peur de ces organismes, alors qu'au contraire, ils sont indispensables à notre vie sur la planète.
Ils sont présents même dans des conditions extrêmes de pression, température, salinité, etc.
Des scientifiques ont estimé que le poids total des micro-organismes présents sur la terre est de 25 fois le poids de toutes
les formes animales. Sur cette immense population, une petite proportion uniquement est maléfique.
Apport bénéfique des micro-organismes
Voici quelques exemples de l'apport bénéfique et indispensable des micro-organismes pour notre vie et notre confort
alimentaire.
- Les bactéries du sol sont extrêmement importantes pour transformer l'azote de l'air en un composé assimilable par les
plantes. L'azote est un composé indispensable à la vie. Alors qu'il représente une fraction très importante de l'air (80%), ni
les animaux, ni la grande majorité des plantes ne peuvent l'utiliser directement.
Ce sont les bactéries qui vont fixer l'azote atmosphérique, le transformer en azote ammoniacal assimilable par les plantes,
puis les animaux se procureront leur source d'azote en se nourrissant de plantes.
- Dans nos intestins, certaines réactions biochimiques permettant d'éliminer les déchets de l'organisme ne peuvent être
réalisées que par des bactéries.
De la même manière alors que les vaches se nourrissent exclusivement de matières cellulosiques, elles ne possèdent pas d'enzyme capable de dégrader la cellulose. Ce sont les bactéries présentes dans leur estomac qui vont réaliser cette
pré-dégradation.
- L'homme utilise beaucoup le travail des micro-organismes pour fabriquer ses produits alimentaires, tels que le pain,
la bière, le vin, les fromages...
- L'une des fonctions primordiales des micro-organismes (qui nous intéresse particulièrement), est celle d'éboueurs
de la planète. Ce sont eux qui transforment toutes les matières organiques mortes (plantes, animaux) ou les déchets
provenant du monde vivant en matières minérales. Sans cette minéralisation des matières organiques par les
micro-organismes, il n'y aurait plus de possibilité de vie sur terre.
La minéralisation correspond à la dégradation des molécules complexes en produits simples tels
que H2O, CO2, CH4, N2, O2, qui retournent
à l'atmosphère et seront utilisés par les êtres vivants pour former de nouvelles molécules organiques. C'est ce que l'on appelle
le cycle de la matière.
La biodégradation correspond à l'élimination complète d'un composé complexe en produits simples.
LE CYCLE DE L'AZOTE
Respiration nitrique:
carbone / hydrogène
oxygène / azote |
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Litière végétale, cadavres. |
Bactéries dénitrifiantes
Matières Azotées |
Micro-organismes
Bactéries de la nitrification
Putréfaction / Humification |
"L'ARBRE DE VIE"
Définition d'un micro-organisme
C'est un organisme vivant unicellulaire ou à cellules non différenciées.
On regroupe sous ce terme les espèces suivantes :
- les algues,
- les protozoaires
- les champignons inférieurs : filamenteux, levures
- les bactéries
- les virus
Dans nos applications, nous ne travaillerons qu'avec les champignons et les bactéries
de classe 1 (EFB)